Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms