Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms