Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf42Q9NWW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf42Q9NWW7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms