Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms