Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms