Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms