Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE3Q9NRF9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms