Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms