Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms