Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR6Q9HBX8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms