Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSPNQ9HAW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms