Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms