Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REEP4Q9H6H4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REEP4Q9H6H4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms