Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms