Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms