Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms