Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms