Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms