Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms