Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms