Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms