Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms