Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC38A2Q96QD8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms