Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP4Q96PP9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP4Q96PP9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms