Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms