Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms