Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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