Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms