Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC005154.1-201ENST00000434399 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms