Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms