Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms