Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms