Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF2Q96CJ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms