Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 FOXP1-203ENST00000327590 5685 ntTSL 28.29□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 34.6
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TBRG4Q969Z0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 34.6
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TBRG4Q969Z0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 34.5
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TBRG4Q969Z0 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 321.16■□□□□ 0.987e-17■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 34.5
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TBRG4Q969Z0 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.557e-17■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-206ENST00000444971 1508 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-204ENST00000325960 1552 ntTSL 26.43□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-210ENST00000479877 1855 ntTSL 25.09□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-213ENST00000536355 571 ntTSL 44.5□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-212ENST00000492359 541 ntTSL 44□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-208ENST00000466035 778 ntTSL 33.65□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.033e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.033e-6■■■■■ 34.5
TBRG4Q969Z0 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt23.26■■□□□ 1.314e-10■■■■■ 34.4
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TBRG4Q969Z0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 34.4
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TBRG4Q969Z0 NRBP2-207ENST00000531729 1064 ntTSL 1 (best)23.34■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 NRBP2-210ENST00000533846 1623 ntTSL 1 (best)23.26■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 UAP1L1-204ENST00000476184 645 ntTSL 321.55■■□□□ 1.043e-9■■■■■ 34.4
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TBRG4Q969Z0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.696e-8■■■■■ 34.4
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TBRG4Q969Z0 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 515.8■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 GFOD2-204ENST00000602496 2029 ntTSL 515.47■□□□□ 0.076e-8■■■■■ 34.4
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TBRG4Q969Z0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 513.35□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 412.47□□□□□ -0.416e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-11■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 GFOD2-202ENST00000602279 5507 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 39.29□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 49.28□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 ASXL2-204ENST00000497092 549 ntTSL 24.02□□□□□ -1.776e-8■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 214.85□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 34.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 27.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 34.3
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