Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms