Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms