Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms