Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms