Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms