Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CSNK2A3Q8NEV1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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