Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF439Q8NDP4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF439Q8NDP4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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