Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms