Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP38Q8NB14 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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