Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms