Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN19Q8N6F1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms