Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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