Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms