Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms