Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VSTM1Q6UX27 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms