Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC4Q6P2E9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms